21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2937 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2937  C-5 cytosine-specific DNA methylase  100 
 
 		 692 aa  1377    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.241378  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2374  C-5 cytosine-specific DNA methylase  55.39 
 
 		 636 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0270809  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0658  C-5 cytosine-specific DNA methylase  48.91 
 
 		 648 aa  613  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.538294  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2369  C-5 cytosine-specific DNA methylase  60.16 
 
 		 596 aa  543  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269953  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1185  C-5 cytosine-specific DNA methylase  56.42 
 
 		 559 aa  526  1e-148  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00256863  normal  0.326203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1720  C-5 cytosine-specific DNA methylase  55.04 
 
 		 434 aa  485  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000451649 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2352  C-5 cytosine-specific DNA methylase  56.07 
 
 		 559 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1717  C-5 cytosine-specific DNA methylase  64.84 
 
 		 135 aa  161  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000204575 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2452  hypothetical protein  42.86 
 
 		 177 aa  121  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000760235  unclonable  0.000000000305739 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1573  C-5 cytosine-specific DNA methylase  55.56 
 
 		 107 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00203711  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1093  C-5 cytosine-specific DNA methylase  55.56 
 
 		 107 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00117815  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4309  DNA-cytosine methyltransferase  27.6 
 
 		 374 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0990622  normal  0.0453977 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1175  DNA-cytosine methyltransferase  28.82 
 
 		 349 aa  51.2  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4269  DNA-cytosine methyltransferase  27.48 
 
 		 359 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0700  DNA-cytosine methyltransferase  28.64 
 
 		 320 aa  49.7  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2314  DNA-cytosine methyltransferase  27.94 
 
 		 340 aa  45.1  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.704291 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4262  DNA-cytosine methyltransferase  26.11 
 
 		 415 aa  44.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  25 
 
 		 438 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2193  DNA-cytosine methyltransferase  23 
 
 		 358 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.877984  normal  0.072963 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3681  modification methylase HgiDII  26.76 
 
 		 344 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2196  DNA-cytosine methyltransferase  26.79 
 
 		 366 aa  43.9  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.227819  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>