14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4197 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4197  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  645    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1969  hypothetical protein  70.57 
 
 
316 aa  437  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.403251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4858  hypothetical protein  31.31 
 
 
327 aa  146  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0228529  normal  0.590895 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6748  DNA polymerase, beta-like region  31.11 
 
 
321 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4404  DNA polymerase, beta-like region  30.84 
 
 
321 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4493  DNA polymerase, beta-like region  30.56 
 
 
321 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.521914  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2372  hypothetical protein  31.96 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0126  hypothetical protein  25.69 
 
 
321 aa  92.4  9e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5985  DNA polymerase, beta-like region  27.61 
 
 
163 aa  57.4  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13910  hypothetical protein  23.25 
 
 
315 aa  52  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2822  hypothetical protein  24.28 
 
 
449 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.816333  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4359  hypothetical protein  25.71 
 
 
365 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0687672  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0222  hypothetical protein  25.08 
 
 
363 aa  46.2  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2233  hypothetical protein  27.5 
 
 
309 aa  42.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000107793  hitchhiker  0.00000113425 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>