26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3959 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3959  hypothetical protein  100 
 
 
109 aa  218  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1777  hypothetical protein  38.89 
 
 
112 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.297893  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00427  hypothetical protein  38.1 
 
 
107 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0054  hypothetical protein  38.1 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0808  hypothetical protein  38.3 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0514  hypothetical protein  32.41 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.95823e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3553  hypothetical protein  35 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1273  membrane protein  34 
 
 
110 aa  66.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.346096  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3038  hypothetical protein  33.66 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47742  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3216  hypothetical protein  32 
 
 
111 aa  61.6  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000833227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4164  hypothetical protein  29.81 
 
 
107 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0432807  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05030  hypothetical protein  32.38 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0484  hypothetical protein  32.38 
 
 
107 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0784  hypothetical protein  31.78 
 
 
114 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000145033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4184  hypothetical protein  26.17 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0470  hypothetical protein  29.52 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5053  hypothetical protein  29.52 
 
 
107 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3293  hypothetical protein  30 
 
 
111 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3780  hypothetical protein  30 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0545  hypothetical protein  30 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3906  hypothetical protein  30 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3723  hypothetical protein  30 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0584  hypothetical protein  30 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3445  hypothetical protein  30 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0585  hypothetical protein  30 
 
 
111 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.182991 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0586  hypothetical protein  30 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>