12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0845 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0845  LmbE family protein  100 
 
 		 445 aa  924    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4989  hypothetical protein  31.3 
 
 		 478 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0531  LmbE-like protein  31.01 
 
 		 469 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4941  LmbE family protein  31.3 
 
 		 467 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.979997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4813  LmbE family protein  31.01 
 
 		 476 aa  182  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4990  LmbE family protein  31.88 
 
 		 467 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66140  hypothetical protein  31.46 
 
 		 472 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0596  LmbE family protein  31.32 
 
 		 462 aa  179  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0527  LmbE family protein  31.01 
 
 		 467 aa  179  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.860453  normal  0.132205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0476  LmbE-like protein  29.21 
 
 		 485 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.256503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5737  hypothetical protein  31.03 
 
 		 473 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44690  LmbE family protein  31.99 
 
 		 487 aa  171  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.224172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>