49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0183 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_0172  hypothetical protein  96.07 
 
 
331 aa  637    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0192  hypothetical protein  99.7 
 
 
348 aa  657    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0183  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  659    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0222  hypothetical protein  75.38 
 
 
328 aa  488  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal  0.0567113 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0445  hypothetical protein  71.76 
 
 
342 aa  478  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10218  hypothetical protein  70.83 
 
 
337 aa  423  1e-117  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1615  acyl dehydratase-like protein  61.33 
 
 
332 aa  365  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4181  Acyl dehydratase-like protein  62.27 
 
 
333 aa  359  4e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6829  hypothetical protein  56.73 
 
 
343 aa  333  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4299  dehydratase  58.75 
 
 
350 aa  313  2.9999999999999996e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313691  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1430  dehydratase  29.23 
 
 
349 aa  104  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4149  MaoC-like dehydratase  29.87 
 
 
359 aa  96.7  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4428  MaoC-like dehydratase  29.87 
 
 
353 aa  94  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000912806  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4037  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 
348 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3781  dehydratase  28.57 
 
 
348 aa  92.8  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1970  dehydratase  28.84 
 
 
353 aa  92  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0961823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1326  MaoC domain protein dehydratase  28.57 
 
 
359 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223229 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2871  putative thiol ester dehydrase/isomerase  27.89 
 
 
343 aa  91.3  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4075  MaoC domain protein dehydratase  28.25 
 
 
348 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4172  dehydratase  28.45 
 
 
353 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1201  MaoC-like dehydratase  29.05 
 
 
353 aa  91.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3627  MaoC domain protein dehydratase  29.14 
 
 
348 aa  89  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0913  dehydratase  28.12 
 
 
352 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3940  dehydratase  29.32 
 
 
348 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0813  hypothetical protein  26.81 
 
 
343 aa  83.6  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5003  dehydratase  29.34 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4465  dehydratase  26.52 
 
 
347 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0085  dehydratase  25.85 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0973  MaoC family protein  26.42 
 
 
343 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  26.67 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2633  dehydratase  26.44 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3523  hypothetical protein  28 
 
 
346 aa  63.9  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.839256  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  24.23 
 
 
344 aa  63.5  0.000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1534  MaoC-like dehydratase  26.92 
 
 
150 aa  48.9  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.734487  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  26.45 
 
 
169 aa  48.9  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2758a  hypothetical protein  30.08 
 
 
150 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.382908 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  27.45 
 
 
176 aa  47.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  25 
 
 
168 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3337  MaoC domain protein dehydratase  25.97 
 
 
384 aa  46.2  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.191953  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  24.16 
 
 
166 aa  46.2  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  22.78 
 
 
172 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  22.78 
 
 
172 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  24.16 
 
 
166 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  27.92 
 
 
150 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4064  dehydratase  25 
 
 
173 aa  44.3  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4972  dehydratase  25.93 
 
 
153 aa  43.9  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.810088  normal  0.1102 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  24.16 
 
 
168 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0007  MaoC domain protein dehydratase  24.14 
 
 
155 aa  42.7  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4375  MaoC domain protein dehydratase  27.27 
 
 
150 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>