15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2654 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2654  hypothetical protein  100 
 
 
221 aa  464  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.174431  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2075  hypothetical protein  97.74 
 
 
221 aa  454  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.571186  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1299  hypothetical protein  79.64 
 
 
220 aa  363  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.222208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2846  hypothetical protein  80.09 
 
 
220 aa  365  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.444651  normal  0.805007 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1595  hypothetical protein  32.02 
 
 
283 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.154621  normal  0.47842 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1861  hypothetical protein  30.92 
 
 
279 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000038484  hitchhiker  0.0000000000000261037 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4462  hypothetical protein  24.51 
 
 
218 aa  75.5  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000206181 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3227  hypothetical protein  32.37 
 
 
172 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175378  normal  0.0142189 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3072  hypothetical protein  27.45 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.688682  hitchhiker  0.0000829629 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0254  hypothetical protein  23.56 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2381  hypothetical protein  28.21 
 
 
183 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2836  hypothetical protein  31.3 
 
 
220 aa  58.5  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000263476  hitchhiker  0.0000925306 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3100  hypothetical protein  32.56 
 
 
175 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0248647  decreased coverage  0.0000135687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1891  hypothetical protein  37.78 
 
 
156 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0049  hypothetical protein  26.15 
 
 
280 aa  45.1  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.317193 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>