23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2188 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2188  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 		 117 aa  238  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000563626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2232  hypothetical protein  39.39 
 
 		 101 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.242019  normal  0.515719 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1541  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  34.78 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2957  anti-sigma-factor antagonist  32.1 
 
 		 100 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1963  STAS domain protein  31.43 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.259711  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2820  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0314331 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34370  antisigma-factor antagonist STAS domain protein  34.55 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4364  anti-sigma-factor antagonist  22.68 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.557129 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1503  anti-sigma-factor antagonist  22.68 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.696241  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3579  anti-sigma-factor antagonist  30.36 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3689  anti-sigma-factor antagonist  26.67 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3925  anti-sigma-factor antagonist  22.68 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.406637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3117  anti-anti-sigma regulatory factor  29.07 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2180  flagellar basal-body rod protein FlgB  32.73 
 
 		 129 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3452  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38.18 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.466044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1783  hypothetical protein  34.55 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20770  hypothetical protein  32.73 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0733  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  34.48 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01716  putative anti-sigma factor antagonist  33.33 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1593  anti-sigma-factor antagonist  31.03 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2158  anti-sigma-factor antagonist  32.08 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.809632  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0440  anti-sigma-factor antagonist  24.47 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0996499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0156  putative anti-sigma F factor antagonist  30.91 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>