17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0130 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0130  anticodon nuclease  100 
 
 		 366 aa  761    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.4198 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2396  anticodon nuclease  72.31 
 
 		 377 aa  550  1e-155  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000000459061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0449  anticodon nuclease  60.11 
 
 		 366 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000618209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0926  anticodon nuclease  59.13 
 
 		 390 aa  433  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000288709  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3716  anticodon nuclease  59.69 
 
 		 401 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2620  hypothetical protein  56.99 
 
 		 439 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.98214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1219  anticodon nuclease  57.59 
 
 		 378 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2005  anticodon nuclease  54.26 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  normal  0.799191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2374  anticodon nuclease, putative  54.26 
 
 		 392 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.815652  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3054  anticodon nuclease PrrC  33.16 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.165862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1086  anticodon nuclease  33.88 
 
 		 383 aa  182  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.028273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4395  hypothetical protein  33.01 
 
 		 410 aa  175  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.414089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0776  anticodon nuclease  35.48 
 
 		 292 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0815  anticodon nuclease  52.31 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1533  hypothetical protein  23.61 
 
 		 757 aa  49.7  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3703  hypothetical protein  29.34 
 
 		 710 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0040  DNA repair ATPase  27.85 
 
 		 1051 aa  43.1  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.00000057692  hitchhiker  0.00102482 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>