21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1411 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1411  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  391  1e-108  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0508  hypothetical protein  95.26 
 
 
190 aa  380  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0329  hypothetical protein  93.68 
 
 
190 aa  375  1e-103  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0574  hypothetical protein  79.47 
 
 
190 aa  327  5.0000000000000004e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1035  hypothetical protein  37.5 
 
 
325 aa  48.1  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.275565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1533  hypothetical protein  36.21 
 
 
165 aa  46.2  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.475102  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3230  hypothetical protein  37.5 
 
 
169 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0497  hypothetical protein  37.25 
 
 
164 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000155339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2942  hypothetical protein  35.29 
 
 
169 aa  44.7  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.128852 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3771  antifreeze protein type I  34.88 
 
 
433 aa  44.7  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000603754  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2048  hypothetical protein  25.49 
 
 
265 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.113885  normal  0.045835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1756  putative virion core protein (lumpy skin disease virus)-like protein  30.68 
 
 
388 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 
823 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0681  hypothetical protein  34.48 
 
 
125 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3718  hypothetical protein  34 
 
 
169 aa  42.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431162 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08990  hypothetical protein  32.35 
 
 
142 aa  42  0.005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.910252  normal  0.577713 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11760  hypothetical protein  32.05 
 
 
157 aa  42  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.032321 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3116  FHA domain containing protein  24.49 
 
 
383 aa  41.6  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2655  hypothetical protein  32.14 
 
 
170 aa  41.2  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0831745  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1477  hypothetical protein  22.9 
 
 
155 aa  41.2  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0586  hypothetical protein  37.5 
 
 
299 aa  41.2  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>