14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1665 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1665  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  147  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0930  hypothetical protein  81.33 
 
 
75 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1202  hypothetical protein  63.01 
 
 
74 aa  93.2  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1016  hypothetical protein  80.95 
 
 
42 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  43.06 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  31.43 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  29.58 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4516  hypothetical protein  34.85 
 
 
83 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.984435  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4648  hypothetical protein  34.85 
 
 
83 aa  47  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170039  normal  0.0241451 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  33.78 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3643  hypothetical protein  31.43 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4371  hypothetical protein  26.76 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455488  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0877  hypothetical protein  28.77 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  29.58 
 
 
88 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>