21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1683 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1683  cellulose biosynthetic (CelD)-like protein  100 
 
 
359 aa  730    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.548843  normal  0.0452897 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1755  cellulose biosynthesis protein CelD  38.59 
 
 
359 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.189987  normal  0.140777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7654  cellulose biosynthesis protein CelD  30.4 
 
 
376 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0440  hypothetical protein  29.09 
 
 
372 aa  153  5e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.463768 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3587  hypothetical protein  30.95 
 
 
363 aa  149  7e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1930  polysaccharide biosynthesis protein CelD  32.86 
 
 
360 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0135323  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0656  hypothetical protein  34 
 
 
349 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1928  polysaccharide biosynthesis protein CelD  28.65 
 
 
364 aa  143  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411311  normal  0.123399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4871  hypothetical protein  28.81 
 
 
360 aa  142  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1351  hypothetical protein  27.65 
 
 
376 aa  133  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3602  polysaccharide biosynthesis protein CelD  28.85 
 
 
363 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.317396  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7661  polysaccharide biosynthesis protein CelD  31.51 
 
 
363 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2354  hypothetical protein  27.6 
 
 
381 aa  120  4.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0664  cellulose biosynthesis protein CelD  28.4 
 
 
326 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250925 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0307  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  25.24 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5867  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  23.83 
 
 
434 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325984  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1636  conserved hypothetical protein; putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  25.44 
 
 
397 aa  44.3  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.564108  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1858  hypothetical protein  31.17 
 
 
318 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.293436  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2433  protein involved in cellulose biosynthesis (CelD)-like protein  24.92 
 
 
407 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1603  putative acyl-CoA N-acyltransferase related protein  24.92 
 
 
400 aa  43.5  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.241513  normal  0.216431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6618  cellulose biosynthesis protein CelD  24.14 
 
 
437 aa  43.1  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.674224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>