More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1665 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  100 
 
 
332 aa  670    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  50.3 
 
 
333 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  50.3 
 
 
333 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  50 
 
 
333 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  50 
 
 
333 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  48.95 
 
 
333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  49.7 
 
 
334 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  50.9 
 
 
328 aa  294  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  48.95 
 
 
333 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  49.55 
 
 
327 aa  292  6e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  48.94 
 
 
327 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  46.99 
 
 
331 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  39.58 
 
 
327 aa  217  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  36.2 
 
 
337 aa  201  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  35.28 
 
 
361 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  35.71 
 
 
331 aa  187  2e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  35.11 
 
 
317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  34.48 
 
 
317 aa  183  4.0000000000000006e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  38.7 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  39.94 
 
 
319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  36.1 
 
 
334 aa  169  7e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  35.22 
 
 
506 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  37.9 
 
 
392 aa  155  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  33.57 
 
 
376 aa  149  6e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  33.9 
 
 
408 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  30.75 
 
 
491 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  34.51 
 
 
301 aa  122  6e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 
304 aa  122  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
336 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  32.23 
 
 
346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
336 aa  116  5e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
301 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
309 aa  110  3e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0378  glycosyl transferase family protein  34.18 
 
 
339 aa  110  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
318 aa  109  6e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  33.48 
 
 
309 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  31.06 
 
 
321 aa  107  4e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0575  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
323 aa  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.596232  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  30.94 
 
 
301 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  33.04 
 
 
329 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.226663 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0327  glycosyl transferase family protein  33.06 
 
 
336 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4143  glycosyl transferase family protein  33.82 
 
 
323 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  32.89 
 
 
308 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 
307 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
316 aa  97.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 
322 aa  97.1  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1487  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3133  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2916  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0102  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
326 aa  96.7  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0555  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
326 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
320 aa  96.3  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0738  glycosyl transferase family protein  36.32 
 
 
354 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0570  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
326 aa  96.3  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  28.51 
 
 
320 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  28.51 
 
 
320 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
320 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
320 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  28.51 
 
 
320 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
320 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  28.51 
 
 
320 aa  95.9  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  32.91 
 
 
322 aa  95.5  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2822  glycosyl transferase family protein  34.53 
 
 
324 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2197  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
324 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2811  glycosyl transferase family protein  34.6 
 
 
324 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
324 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  29.11 
 
 
324 aa  94.4  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
324 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  30.47 
 
 
329 aa  93.6  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 
324 aa  94  4e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  25.55 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2729  glycosyl transferase family protein  34.27 
 
 
332 aa  92.8  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0490  glycosyl transferase family protein  33.6 
 
 
369 aa  92.4  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
320 aa  92.4  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6141  glycosyl transferase family protein  34.78 
 
 
324 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2871  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 
332 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0461  glycosyl transferase family protein  34.12 
 
 
354 aa  90.1  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 
304 aa  89.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  26.72 
 
 
322 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  26.34 
 
 
322 aa  89  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
309 aa  89  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1160  anthranilate phosphoribosyltransferase  33.78 
 
 
348 aa  86.7  6e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
319 aa  84  0.000000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
319 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  27.66 
 
 
319 aa  84  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0305  glycosyl transferase family protein  29.28 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0374  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 
337 aa  77  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.250133 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1980  glycosyl transferase family protein  24.68 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0908  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.51 
 
 
344 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000806391  hitchhiker  0.0000000035937 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.6 
 
 
341 aa  76.3  0.0000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1532  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.49 
 
 
530 aa  75.1  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.65 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3624  anthranilate phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1116  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.29 
 
 
326 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3065  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.53 
 
 
359 aa  72.8  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00243568  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0873  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.72 
 
 
345 aa  71.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>