25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1386 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1386  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  374  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.650563 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1133  hypothetical protein  38.64 
 
 
186 aa  88.6  5e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.236649  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2517  hypothetical protein  39.33 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.130211  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1222  protein of unknown function, Spy-related  30.34 
 
 
173 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0499596  normal  0.270863 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3500  protein of unknown function Spy-related  27.19 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.764021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4131  periplasmic stress adaptor protein CpxP  30.08 
 
 
162 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00000337772  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0082  periplasmic stress adaptor protein CpxP  30.08 
 
 
162 aa  48.5  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0085  periplasmic stress adaptor protein CpxP  30.08 
 
 
162 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.359879  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0677  hypothetical protein  34 
 
 
159 aa  48.1  0.00009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.00000000000364222  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1751  hypothetical protein  26.32 
 
 
152 aa  48.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0000749705  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0320  hypothetical protein  31.19 
 
 
185 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000449922  hitchhiker  0.0000000108776 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1805  hypothetical protein  25.66 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1561  periplasmic repressor CpxP  30.25 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000204071  unclonable  0.00000000000190173 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2796  putative periplasmic protein CpxP  29.82 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000203252  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00148  periplasmic repressor CpxP  33.33 
 
 
169 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2263  periplasmic repressor CpxP  30.82 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4059  periplasmic repressor CpxP  31.62 
 
 
166 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000356086  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0137  putative stress resistance protein  29.93 
 
 
174 aa  42  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0368  protein of unknown function, Spy-related  27.72 
 
 
163 aa  42  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000528053  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2279  protein of unknown function Spy-related  28.04 
 
 
155 aa  42  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4347  periplasmic repressor CpxP  28.99 
 
 
166 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.470719  hitchhiker  0.0000000613131 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4391  periplasmic repressor CpxP  28.99 
 
 
166 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.454444  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4306  periplasmic repressor CpxP  28.99 
 
 
166 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4458  periplasmic repressor CpxP  28.99 
 
 
166 aa  42  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4277  periplasmic repressor CpxP  28.99 
 
 
166 aa  41.2  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.5664 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>