17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2517 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2517  hypothetical protein  100 
 
 
239 aa  435  1e-121  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.130211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1386  hypothetical protein  40 
 
 
200 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.650563 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1133  hypothetical protein  40 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.236649  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0090  hypothetical protein  36.67 
 
 
191 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00936668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2306  hypothetical protein  37.08 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2329  hypothetical protein  37.08 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0328  hypothetical protein  37.08 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0632946  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0138  hypothetical protein  37.08 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0122  hypothetical protein  37.08 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.859357  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2255  hypothetical protein  37.08 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2830  hypothetical protein  37.08 
 
 
189 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0613514  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6244  hypothetical protein  31.11 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.830446  normal  0.907654 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0157  hypothetical protein  30 
 
 
250 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0655  Pericardin like protein  36.63 
 
 
684 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.541208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0541  hypothetical protein  32.12 
 
 
178 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0756751  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0927  hypothetical protein  27.21 
 
 
153 aa  42  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000237376  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0068  hypothetical protein  42.62 
 
 
203 aa  41.6  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>