60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1317 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1317  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
533 aa  1062    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.573669  normal  0.99771 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20870  Tetratricopeptide repeat (TPR) protein  41.3 
 
 
539 aa  346  8e-94  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2694  TPR repeat-containing protein  39.43 
 
 
580 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.407623  normal  0.0520639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2335  Tetratricopeptide domain protein  40.23 
 
 
563 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0555  tetratricopeptide region  36.94 
 
 
560 aa  334  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.45789  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2675  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.3 
 
 
572 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.3 
 
 
572 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1851  TPR repeat-containing protein  41.01 
 
 
571 aa  313  4.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4467  Tetratricopeptide repeat protein  38.45 
 
 
568 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1877  hypothetical protein  39.03 
 
 
587 aa  301  2e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.220347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1969  hypothetical protein  39.14 
 
 
581 aa  300  4e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1371  TPR repeat-containing protein  40.5 
 
 
601 aa  298  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432859  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1581  Tetratricopeptide domain protein  36.36 
 
 
578 aa  288  2e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00337533  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2863  TPR repeat-containing protein  37.37 
 
 
525 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0105182  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2869  hypothetical protein  35.58 
 
 
568 aa  274  3e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.451672  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2307  TPR repeat-containing protein  39.84 
 
 
598 aa  273  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.062343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2264  hypothetical protein  35.66 
 
 
621 aa  267  5e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.750308  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3291  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.87 
 
 
625 aa  257  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03987  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G00240)  33.39 
 
 
580 aa  256  7e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0768  TPR repeat-containing protein  34.36 
 
 
552 aa  249  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0989  hypothetical protein  32.82 
 
 
577 aa  243  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.659659  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3942  TPR repeat-containing protein  34.72 
 
 
563 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  0.567153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1004  TPR repeat-containing protein  36.91 
 
 
625 aa  239  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4301  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 
625 aa  238  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2813  TPR repeat-containing protein  36.12 
 
 
563 aa  233  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48594  normal  0.196641 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.83 
 
 
584 aa  232  1e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2796  TPR repeat-containing protein  36.12 
 
 
563 aa  233  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal  0.742166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2769  tetratricopeptide TPR_2  36.12 
 
 
563 aa  233  1e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156917  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3331  TPR repeat-containing protein  35.47 
 
 
565 aa  230  6e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643296  normal  0.0437808 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02878  conserved hypothetical protein  32.69 
 
 
594 aa  229  1e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.291051 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1486  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 
623 aa  223  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03470  conserved expressed protein  31.67 
 
 
576 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0846142  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1465  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 
574 aa  216  9e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2608  TPR domain-containing protein  33.92 
 
 
601 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02657  conserved hypothetical protein  30.05 
 
 
600 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000025246  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3057  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
559 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1379  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 
559 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1219  TPR domain-containing protein  33.7 
 
 
537 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121944  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0186  TPR domain-containing protein  33.7 
 
 
537 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240778  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0462  TPR domain-containing protein  33.7 
 
 
537 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1113  TPR repeat-containing protein  33.7 
 
 
537 aa  203  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0381  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.43 
 
 
559 aa  192  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.850569  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38668  predicted protein  31.65 
 
 
626 aa  148  2.0000000000000003e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0793283  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5657  tetratricopeptide TPR_4  29.88 
 
 
530 aa  144  4e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1942  tetratricopeptide TPR_4  29.59 
 
 
530 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3941  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.41 
 
 
871 aa  95.1  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2242  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
541 aa  94  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433133  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3655  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 
506 aa  91.7  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1061  tetratricopeptide domain-containing protein  27.63 
 
 
556 aa  83.6  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2073  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 
532 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  36.08 
 
 
935 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2697  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 
268 aa  49.7  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000108911  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 
3172 aa  48.5  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1170  cellulose synthase domain-containing protein  43.75 
 
 
1271 aa  48.1  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.456707  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5839  cellulose synthase operon C domain protein  42.86 
 
 
1569 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0252988  normal  0.398453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2043  putative cellulose synthase operon protein C  43.94 
 
 
1588 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.360789 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  24.04 
 
 
1764 aa  45.8  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  44.12 
 
 
622 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3253  cellulose synthase domain-containing protein  36.62 
 
 
1542 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.706167  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  35.05 
 
 
725 aa  43.5  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>