15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0427 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0427  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  371  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.176297  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  40.78 
 
 
816 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  39.66 
 
 
963 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1482  hypothetical protein  39.31 
 
 
470 aa  86.3  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3048  hypothetical protein  37.34 
 
 
175 aa  85.9  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.987312  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  37.4 
 
 
767 aa  67.8  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4208  hypothetical protein  29.45 
 
 
486 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  35.92 
 
 
693 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  34.58 
 
 
685 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  34.21 
 
 
1042 aa  48.9  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2004  PKD domain containing protein  42.03 
 
 
584 aa  46.6  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.361042  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0242  Ig-like, group 2  33.11 
 
 
536 aa  45.1  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0441  surface protein  30.19 
 
 
681 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0396  triple helix repeat-containing collagen  31.87 
 
 
684 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0162411  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2441  PKD  31.87 
 
 
996 aa  42.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000010419  normal  0.547756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>