24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_R0005 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_R0005  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  178  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0059  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386206  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14045  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553863  normal  0.2152 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0056  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0063  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588246  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0058  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14042  tRNA-Ser  88.89 
 
 		 90 bp  99.6  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.417053 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0057  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.861934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0004  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 86 bp  71.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01650  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851921  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0005  tRNA-Ser  95.45 
 
 		 85 bp  71.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0008  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0056  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.133866  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0055  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0053  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0980928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0060  tRNA-Ser  85.71 
 
 		 91 bp  69.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.948635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 90 bp  52  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0007  tRNA-Ser  100 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0054  tRNA-Ser  96.67 
 
 		 91 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0001  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36870  tRNA-Ser  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.339206  normal  0.059876 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01840  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  44.1  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0010  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0042  tRNA-Ala  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000030299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>