16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_R0057 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_R0057  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.861934  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0004  tRNA-Ser  94.19 
 
 		 86 bp  123  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01650  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  91.7  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851921  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0059  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386206  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0058  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0063  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.588246  normal  0.972006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0056  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0005  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 90 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14045  tRNA-Ser  97.5 
 
 		 87 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.553863  normal  0.2152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0005  tRNA-Ser  95.24 
 
 		 85 bp  67.9  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0006  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 88 bp  50.1  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0005  tRNA-Ser  87.04 
 
 		 90 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.64663 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0065  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.10378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0051  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0072  tRNA-Ser  93.33 
 
 		 92 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0637954 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0005  tRNA-Ser  96.15 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.510995 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>