17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3992 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3992  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 273 aa  496  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  0.560711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2105  UbiA prenyltransferase  45.83 
 
 		 270 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5948  hypothetical protein  54.46 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4393  UbiA prenyltransferase  47.15 
 
 		 290 aa  149  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1161  UbiA prenyltransferase  53.61 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786888  hitchhiker  0.00393924 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20380  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  50 
 
 		 271 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18930  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  46.19 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.401268  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0650  UbiA prenyltransferase  48.92 
 
 		 282 aa  125  6e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5114  UbiA prenyltransferase  47.92 
 
 		 263 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0148  UbiA prenyltransferase  44.53 
 
 		 258 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4697  UbiA prenyltransferase  43.68 
 
 		 303 aa  112  6e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.232584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4267  UbiA prenyltransferase  38.43 
 
 		 310 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00490  hypothetical protein  39.63 
 
 		 264 aa  80.9  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.295551  normal  0.866332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4041  hypothetical protein  30.1 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3530  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  32.34 
 
 		 301 aa  47  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.47035 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1515  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  27.91 
 
 		 289 aa  46.2  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.323447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.46 
 
 		 303 aa  43.9  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>