More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2214 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2214  malate dehydrogenase  100 
 
 
316 aa  621  1e-177  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.359473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4481  malate dehydrogenase  93.99 
 
 
397 aa  553  1e-156  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.437151  normal  0.103814 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3991  malate dehydrogenase  92.03 
 
 
391 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.122747  normal  0.205066 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3977  malate dehydrogenase  92.03 
 
 
391 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4051  malate dehydrogenase  92.03 
 
 
391 aa  531  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.812595  normal  0.971942 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0588  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  81.27 
 
 
405 aa  443  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30630  malic enzyme  75.56 
 
 
396 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235375  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6279  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  70.72 
 
 
392 aa  404  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.69879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2900  malate dehydrogenase  64.35 
 
 
394 aa  392  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0280773  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3994  malate dehydrogenase  68.52 
 
 
404 aa  385  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0562  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  64.45 
 
 
428 aa  382  1e-105  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4173  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  64.78 
 
 
416 aa  380  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0980  malate dehydrogenase  64.45 
 
 
464 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.428003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3685  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  64.45 
 
 
395 aa  374  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3684  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  65.45 
 
 
399 aa  374  1e-102  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.502842  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5158  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  61.46 
 
 
386 aa  365  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8298  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  64.9 
 
 
397 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.890425  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1727  malate dehydrogenase  62.3 
 
 
396 aa  362  5.0000000000000005e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.993895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3773  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  68.2 
 
 
399 aa  360  2e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7700  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  66.22 
 
 
405 aa  360  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474841  normal  0.880445 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1110  malate dehydrogenase  56.77 
 
 
481 aa  342  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.421684  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3695  malate dehydrogenase  64.24 
 
 
391 aa  342  7e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.669073  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3751  malate dehydrogenase  63.55 
 
 
408 aa  338  5e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.131564  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4075  malate dehydrogenase  62.91 
 
 
391 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0926309 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2232  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.8 
 
 
478 aa  335  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1376  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.48 
 
 
478 aa  334  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000390692  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2866  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.86 
 
 
489 aa  332  5e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0409  malate dehydrogenase  53.33 
 
 
383 aa  332  5e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.192997  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0967  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  52.37 
 
 
407 aa  330  2e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1419  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  62.46 
 
 
411 aa  329  3e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0409  malate dehydrogenase  58.09 
 
 
403 aa  329  3e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34210  malic enzyme  57.33 
 
 
466 aa  327  2.0000000000000001e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0622  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.35 
 
 
460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0465  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.77 
 
 
467 aa  325  5e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1467  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  57.19 
 
 
470 aa  324  1e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150192  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0113  malate dehydrogenase  56.73 
 
 
457 aa  324  1e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.191166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0923  malate dehydrogenase  58.65 
 
 
477 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.663709  normal  0.827819 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1919  malate oxidoreductase  53.42 
 
 
387 aa  322  4e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000616521  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3203  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.03 
 
 
463 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2893  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.03 
 
 
463 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0212  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.29 
 
 
500 aa  320  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.455099  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0401  malate dehydrogenase  57.43 
 
 
407 aa  320  1.9999999999999998e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00944416 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0902  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  54.43 
 
 
411 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0366  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.49 
 
 
468 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.697833  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08210  malic enzyme  54.17 
 
 
474 aa  315  5e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1297  malate dehydrogenase  55.78 
 
 
469 aa  315  5e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.428219  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2399  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  50.31 
 
 
399 aa  315  8e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000325026  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3432  malate dehydrogenase  54.79 
 
 
479 aa  315  8e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.231586  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1956  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.27 
 
 
390 aa  314  9.999999999999999e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2923  malate dehydrogenase  51.3 
 
 
414 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440621  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3145  malate dehydrogenase  51.3 
 
 
414 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.232361  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1265  NADP-dependent malic enzyme, putative  49.37 
 
 
409 aa  313  1.9999999999999998e-84  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1656  malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  57.43 
 
 
463 aa  313  1.9999999999999998e-84  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.965749  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3045  NAD-dependent malic enzyme  54.07 
 
 
427 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.900825  normal  0.491141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2286  malate dehydrogenase  52.98 
 
 
474 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0617  putative malate dehydrogenase  51.1 
 
 
399 aa  314  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4722  putative malate dehydrogenase  50.78 
 
 
399 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2490  malate dehydrogenase  52.77 
 
 
473 aa  313  1.9999999999999998e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.148029  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1406  malate dehydrogenase  57.81 
 
 
490 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000179901 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2390  malate dehydrogenase (oxaloacetate decarboxylating)  54.49 
 
 
470 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2803  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  57.48 
 
 
484 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.533173  hitchhiker  0.00320399 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1448  malate dehydrogenase  57.48 
 
 
513 aa  313  3.9999999999999997e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.320703  normal  0.623093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0169  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  55.48 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0642  malate dehydrogenase, putative  50.78 
 
 
399 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0490  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  50.78 
 
 
399 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0492  malate dehydrogenase (malic enzyme) (NAD-malic enzyme)  50.78 
 
 
399 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0635  putative malate dehydrogenase  50.78 
 
 
399 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0830  malate dehydrogenase  54.1 
 
 
403 aa  311  5.999999999999999e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.313277  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3211  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.46 
 
 
481 aa  312  5.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0548  malate dehydrogenase  50.78 
 
 
399 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0579  malate dehydrogenase  50.78 
 
 
399 aa  311  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33400  malic enzyme  55.92 
 
 
473 aa  311  1e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.513398  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3134  putative malate dehydrogenase  50.65 
 
 
414 aa  310  2e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2034  malate dehydrogenase  53.8 
 
 
461 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0493  malate dehydrogenase  51.72 
 
 
400 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4565  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.77 
 
 
476 aa  309  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.423371  normal  0.479967 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20210  malic enzyme  54.81 
 
 
485 aa  308  6.999999999999999e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0344  malate dehydrogenase  52.29 
 
 
390 aa  308  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.318957  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2141  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  53.62 
 
 
474 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1758  malate dehydrogenase  49.06 
 
 
409 aa  306  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1792  malate dehydrogenase  49.06 
 
 
409 aa  306  3e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0140  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.38 
 
 
503 aa  305  8.000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0264  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  57 
 
 
461 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0242  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  53.37 
 
 
414 aa  302  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2458  amino acid-binding ACT  54.82 
 
 
463 aa  301  7.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0499  malate dehydrogenase  51.32 
 
 
401 aa  301  7.000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1706  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  56.67 
 
 
470 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.25266 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0229  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  52.06 
 
 
384 aa  301  8.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4433  malate dehydrogenase  53.14 
 
 
412 aa  300  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1195  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  54.26 
 
 
463 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232421 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0215  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  51.83 
 
 
392 aa  300  2e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.984607  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1947  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  55.45 
 
 
470 aa  298  1e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1062  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  53.82 
 
 
407 aa  296  2e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00425454  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4713  putative malate dehydrogenase  52.83 
 
 
412 aa  296  3e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0138  malic protein NAD-binding  51.48 
 
 
391 aa  296  3e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000809828  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0524  putative malate dehydrogenase  52.83 
 
 
412 aa  295  5e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4734  malate dehydrogenase, putative  52.52 
 
 
412 aa  293  2e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4344  malate dehydrogenase (malic enzyme, NAD-malic enzyme)  52.52 
 
 
402 aa  293  2e-78  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4848  malate dehydrogenase  52.52 
 
 
402 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3983  malate dehydrogenase  53.8 
 
 
462 aa  293  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>