50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0716 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0716  cyclase/dehydrase  100 
 
 
146 aa  304  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0129  cyclase/dehydrase  82.19 
 
 
146 aa  261  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.692417  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  78.77 
 
 
148 aa  248  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  78.77 
 
 
148 aa  248  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  78.77 
 
 
148 aa  248  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10165  hypothetical protein  66.44 
 
 
161 aa  207  4e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5073  cyclase/dehydrase  26.32 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.053477  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24890  polyketide cyclase / dehydrase family protein  30 
 
 
147 aa  68.9  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.370837  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10871  hypothetical protein  25.93 
 
 
147 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0253989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1822  cyclase/dehydrase  27.66 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1678  cyclase/dehydrase  23.31 
 
 
146 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613724  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0938  cyclase/dehydrase  25.69 
 
 
160 aa  60.8  0.000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.567828  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4587  cyclase/dehydrase  23.31 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.467747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4500  cyclase/dehydrase  23.31 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4883  cyclase/dehydrase  23.31 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0833406 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4585  cyclase/dehydrase  26.62 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.446055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6066  cyclase/dehydrase  26.95 
 
 
146 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4498  cyclase/dehydrase  26.62 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1386  cyclase/dehydrase  24.64 
 
 
144 aa  57.4  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.339684  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4881  cyclase/dehydrase  25.9 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142178 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0509  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 
145 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.257831  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2698  hypothetical protein  22.46 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.707169  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4884  cyclase/dehydrase  23.7 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.130016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4501  cyclase/dehydrase  23.7 
 
 
148 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4588  cyclase/dehydrase  23.7 
 
 
148 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.464947 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3095  cyclase/dehydrase  23.53 
 
 
144 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.848378 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5071  cyclase/dehydrase  22.39 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.954892  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3280  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3342  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330453  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3547  cyclase/dehydrase  24.64 
 
 
145 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.464077 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4499  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4586  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.30543 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4882  cyclase/dehydrase  25.19 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.140468 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3044  cyclase/dehydrase  26.09 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0728  cyclase/dehydrase  24.65 
 
 
146 aa  50.1  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2964  cyclase/dehydrase  24.64 
 
 
145 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3112  cyclase/dehydrase  22.86 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3233  cyclase/dehydrase  25.36 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925332  hitchhiker  0.0000878109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1679  cyclase/dehydrase  25 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.846204  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1306  cyclase/dehydrase  19.57 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.138672  normal  0.43501 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12213  hypothetical protein  23.91 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3049  cyclase/dehydrase  21.01 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00119371  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3291  cyclase/dehydrase  25.36 
 
 
145 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.16801 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3329  cyclase/dehydrase  23.19 
 
 
144 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5072  cyclase/dehydrase  24.09 
 
 
146 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.257189  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1484  cyclase/dehydrase  26.39 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.72758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4867  cyclase/dehydrase  23.61 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10874  hypothetical protein  24.82 
 
 
157 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0259226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3276  cyclase/dehydrase  28.57 
 
 
147 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.253678  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10873  hypothetical protein  25 
 
 
144 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.034604 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>