50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0445 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_0445  hypothetical protein  100 
 
 
342 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0222  hypothetical protein  78.74 
 
 
328 aa  522  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.895984  normal  0.0567113 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0192  hypothetical protein  72.06 
 
 
348 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.606739  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0183  hypothetical protein  71.76 
 
 
331 aa  478  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0172  hypothetical protein  71.76 
 
 
331 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10218  hypothetical protein  68.91 
 
 
337 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1615  acyl dehydratase-like protein  62.28 
 
 
332 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4181  Acyl dehydratase-like protein  64.37 
 
 
333 aa  376  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6829  hypothetical protein  53.94 
 
 
343 aa  323  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4299  dehydratase  55.1 
 
 
350 aa  316  4e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0313691  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1430  dehydratase  28.34 
 
 
349 aa  98.6  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4037  MaoC domain protein dehydratase  29.27 
 
 
348 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.809041  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4075  MaoC domain protein dehydratase  29.27 
 
 
348 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3781  dehydratase  29.18 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3627  MaoC domain protein dehydratase  28.13 
 
 
348 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3940  dehydratase  28.05 
 
 
348 aa  86.3  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.015487 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2871  putative thiol ester dehydrase/isomerase  29.14 
 
 
343 aa  86.3  7e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1970  dehydratase  28.83 
 
 
353 aa  85.9  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0961823 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1326  MaoC domain protein dehydratase  26.59 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00223229 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0813  hypothetical protein  28.96 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.97511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4172  dehydratase  26.88 
 
 
353 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4149  MaoC-like dehydratase  28.81 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.684876  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0913  dehydratase  27.27 
 
 
352 aa  76.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.243466  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1201  MaoC-like dehydratase  28.21 
 
 
353 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4465  dehydratase  27.36 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4428  MaoC-like dehydratase  27.88 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000912806  normal  0.477783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0085  dehydratase  25.15 
 
 
343 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5003  dehydratase  27.62 
 
 
349 aa  66.6  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0973  MaoC family protein  25.75 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2633  dehydratase  25.75 
 
 
343 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0566  dehydratase  26.85 
 
 
344 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.090067 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3523  hypothetical protein  27.36 
 
 
346 aa  63.2  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.839256  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1216  dehydratase  25.9 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4088  hypothetical protein  25 
 
 
166 aa  48.9  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977948  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0612  MaoC domain protein dehydratase  25 
 
 
166 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0337105 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4170  MaoC-like dehydratase  22.6 
 
 
172 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00256261  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4180  MaoC-like dehydratase  22.6 
 
 
172 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0213114  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2185  MaoC domain protein dehydratase  24.7 
 
 
348 aa  45.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.0004362  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1721  dehydratase  26.38 
 
 
184 aa  45.4  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.775583  normal  0.261141 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0676  dehydratase  27.61 
 
 
171 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.251329  normal  0.381536 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6513  MaoC domain protein dehydratase  27.27 
 
 
150 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2915  MaoC domain protein dehydratase  26.32 
 
 
152 aa  43.9  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.759057  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00460  acyl dehydratase  27.56 
 
 
165 aa  43.9  0.005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0731  dehydratase  28.29 
 
 
171 aa  43.5  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.29509 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0804  MaoC domain protein dehydratase  24.67 
 
 
156 aa  43.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.637206  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7764  MaoC domain protein dehydratase  27.1 
 
 
167 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2737  MaoC-like dehydratase  25.34 
 
 
168 aa  43.5  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06880  acyl dehydratase  27.27 
 
 
176 aa  43.1  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0670  MaoC-like dehydratase  25.34 
 
 
168 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00727845  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5294  MaoC-like dehydratase  26.71 
 
 
169 aa  42.7  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0746897  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>