37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2419 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2419  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  174  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0103  hypothetical protein  79.31 
 
 
88 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4259  hypothetical protein  48.86 
 
 
88 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3841  hypothetical protein  46.59 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.191666  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3822  hypothetical protein  43.68 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4377  hypothetical protein  44.32 
 
 
88 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605573  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0318  hypothetical protein  47.73 
 
 
88 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118234  normal  0.049984 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2886  hypothetical protein  44.19 
 
 
88 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0110  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3805  hypothetical protein  36.59 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0535  hypothetical protein  40.26 
 
 
86 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254153  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8737  hypothetical protein  35.71 
 
 
85 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0539  hypothetical protein  31.71 
 
 
146 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6387  hypothetical protein  39.24 
 
 
85 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.857181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0845  hypothetical protein  39.33 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2245  hypothetical protein  38.75 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3204  hypothetical protein  39.76 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2793  hypothetical protein  38.55 
 
 
85 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445436  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0834  hypothetical protein  42.05 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3922  hypothetical protein  37.65 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5665  hypothetical protein  39.76 
 
 
86 aa  50.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5644  hypothetical protein  37.5 
 
 
102 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0221  hypothetical protein  34.21 
 
 
102 aa  50.1  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6414  hypothetical protein  37.97 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0521  hypothetical protein  41.25 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1859  hypothetical protein  38.1 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3202  hypothetical protein  44.3 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8153  hypothetical protein  35.71 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2038  hypothetical protein  39.24 
 
 
87 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702942  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1583  hypothetical protein  38.46 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1874  hypothetical protein  43.53 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6973  hypothetical protein  35.9 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3970  hypothetical protein  34.62 
 
 
125 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6878  hypothetical protein  34.62 
 
 
205 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1382  hypothetical protein  34.83 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.122145 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7629  hypothetical protein  33.75 
 
 
85 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4047  hypothetical protein  54.35 
 
 
80 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.756567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>