36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1833 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1833  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  100 
 
 		 289 aa  560  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.498714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2168  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  98.62 
 
 		 289 aa  550  1e-155  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1784  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  83.74 
 
 		 291 aa  424  1e-118  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.708464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0532  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  67.65 
 
 		 279 aa  329  3e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5782  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  68.61 
 
 		 286 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0439498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6006  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  73.93 
 
 		 293 aa  290  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.416409  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1656  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  49.08 
 
 		 281 aa  224  9e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000354952  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2389  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  49.83 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3148  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  44.67 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3533  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  48.71 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3080  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  47.35 
 
 		 315 aa  165  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5944  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  40.68 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0163114 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2435  putative triphosphoribosyl- dephospho-CoA synthetase  44.48 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.581514 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0652  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  40.07 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2865  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  39.64 
 
 		 288 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6486  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  44.04 
 
 		 291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2611  ATP:dephospho-CoA triphosphoribosyl transferase  43.94 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.251639  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2407  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.21 
 
 		 342 aa  97.4  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.457209  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1728  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  32.6 
 
 		 268 aa  82.8  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0767  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.07 
 
 		 288 aa  79.7  0.00000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1295  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.55 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.967286  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0740  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  25.36 
 
 		 293 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.24203  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0213  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  26.85 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1415  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.11 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.231859  normal  0.121023 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1459  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  24.13 
 
 		 293 aa  71.2  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1215  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  25 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.748005 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1228  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  21.11 
 
 		 293 aa  64.3  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0036  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  29.35 
 
 		 295 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0684  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.73 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.383906 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0764  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.52 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0134158  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2583  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  30.57 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.153542  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1891  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  31.25 
 
 		 283 aa  51.6  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1108  hypothetical protein  27.59 
 
 		 268 aa  51.2  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4592  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.26 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0666  triphosphoribosyl-dephospho-CoA protein  28.83 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.308218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1845  triphosphoribosyl-dephospho-CoA synthase  34.82 
 
 		 300 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0473593 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>