26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0358 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0358  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  234  3e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.669865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0289  hypothetical protein  77.59 
 
 
137 aa  191  3e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285754  normal  0.174624 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1624  hypothetical protein  77.59 
 
 
137 aa  187  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0558  hypothetical protein  77.59 
 
 
137 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0770  hypothetical protein  48.31 
 
 
146 aa  110  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  28.91 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0853  hypothetical protein  29.27 
 
 
472 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0118  hypothetical protein  29.82 
 
 
488 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3380  protein of unknown function DUF107  24.79 
 
 
467 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1615  hypothetical protein  28.93 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  29.66 
 
 
488 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  29.92 
 
 
464 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  29.92 
 
 
462 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  28.1 
 
 
464 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0491  transmembrane protein  26.02 
 
 
446 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0348  hypothetical protein  26.89 
 
 
465 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1602  Nodulation efficiency protein NfeD  26.19 
 
 
489 aa  44.3  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  27.27 
 
 
510 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0805  hypothetical protein  30.51 
 
 
491 aa  43.5  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.743385  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0401  hypothetical protein  25.64 
 
 
460 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.680727  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  28.12 
 
 
463 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2149  hypothetical protein  26.83 
 
 
488 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2684  hypothetical protein  28.46 
 
 
454 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1039  hypothetical protein  28.8 
 
 
456 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.649912  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  30.16 
 
 
437 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1805  nodulation competitiveness protein nfeD  25.71 
 
 
557 aa  40.4  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.151355  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>