14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0009 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0009  4-oxalocrotonate tautomerase  100 
 
 
63 aa  122  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.235995  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0719  4-oxalocrotonate tautomerase  75.44 
 
 
64 aa  87  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.5068  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0159  4-oxalocrotonate tautomerase  75.44 
 
 
64 aa  86.3  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0523793 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1743  4-oxalocrotonate tautomerase  74.14 
 
 
64 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0439637  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1510  4-oxalocrotonate tautomerase  51.72 
 
 
61 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.258565  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2466  4-oxalocrotonate tautomerase  53.45 
 
 
61 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1542  4-oxalocrotonate tautomerase  50 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.000000358699  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0079  putative 4-oxalocrotonate tautomerase  49.12 
 
 
62 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000137411  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1055  4-oxalocrotonate tautomerase  48.28 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3030  4-oxalocrotonate tautomerase  49.12 
 
 
67 aa  55.5  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2180  4-oxalocrotonate tautomerase  50.79 
 
 
63 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0810  4-oxalocrotonate tautomerase  39.66 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.267524  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1332  4-oxalocrotonate tautomerase  38.89 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000185416  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2976  4-oxalocrotonate tautomerase  34.48 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.854525 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>