17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4311 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  623  1e-177  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  68.71 
 
 
322 aa  403  1e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  66.67 
 
 
325 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8077  hypothetical protein  63.05 
 
 
402 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  63.27 
 
 
320 aa  382  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  66.33 
 
 
319 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9537  hypothetical protein  63.61 
 
 
327 aa  375  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178978  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  60.61 
 
 
343 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  62.24 
 
 
308 aa  350  2e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  59.04 
 
 
344 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  49.5 
 
 
296 aa  271  8.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  40.98 
 
 
314 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  30.18 
 
 
828 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  23.4 
 
 
517 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  21.86 
 
 
517 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  22.08 
 
 
918 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  22.15 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>