11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4243 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4243  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  354  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.326888  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2274  conjugal transfer TraD  43.42 
 
 		 88 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.667805  normal  0.112089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0270  conjugal transfer TraD family protein  42.86 
 
 		 88 aa  44.7  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0619355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2655  conjugal transfer TraD family protein  42.86 
 
 		 88 aa  44.7  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4224  conjugal transfer TraD  39.44 
 
 		 81 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0545637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4518  conjugal transfer TraD  44.44 
 
 		 89 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.527505 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1545  conjugal transfer TraD  39.06 
 
 		 84 aa  42  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.358728  normal  0.298058 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3230  conjugal transfer TraD  39.44 
 
 		 81 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.64635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0437  conjugal transfer protein traD  41.54 
 
 		 72 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.387063 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1150  conjugal transfer TraD family protein  37.5 
 
 		 76 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0126783  hitchhiker  0.0000022316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0440  conjugal transfer TraD family protein  44.44 
 
 		 78 aa  40.8  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13579  normal  0.614779 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>