13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4149 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4149  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  431  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4599  hypothetical protein  67.36 
 
 
197 aa  259  3e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.475325  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4474  hypothetical protein  51 
 
 
201 aa  203  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295674  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0263  hypothetical protein  50 
 
 
201 aa  200  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4971  hypothetical protein  49 
 
 
201 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.771788 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4735  hypothetical protein  48 
 
 
201 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4654  hypothetical protein  46.91 
 
 
199 aa  181  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299932  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8078  hypothetical protein  47.94 
 
 
200 aa  181  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429436  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4312  hypothetical protein  43 
 
 
201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.302442  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6183  protein of unknown function DUF1419  45.08 
 
 
205 aa  165  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0293279 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4891  hypothetical protein  44.72 
 
 
200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.632604 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9160  hypothetical protein  46.07 
 
 
179 aa  158  6e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9538  hypothetical protein  42.49 
 
 
241 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.145256  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>