22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3494 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_3494  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  319  9.000000000000001e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2082  hypothetical protein  40.74 
 
 
169 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2002  hypothetical protein  40.74 
 
 
169 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0837  hypothetical protein  35.88 
 
 
180 aa  99.4  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3980  hypothetical protein  33.06 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0305  hypothetical protein  31.25 
 
 
169 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0147  hypothetical protein  31.06 
 
 
173 aa  62  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0125  hypothetical protein  29.75 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1236  hypothetical protein  32.16 
 
 
162 aa  57.4  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.690863 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4307  hypothetical protein  27.73 
 
 
161 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0123  hypothetical protein  27.27 
 
 
171 aa  55.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6793  hypothetical protein  33.65 
 
 
161 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0468  hypothetical protein  41.67 
 
 
161 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.591914  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3262  hypothetical protein  31.11 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2292  hypothetical protein  27.54 
 
 
163 aa  50.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2772  hypothetical protein  36.64 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.12235  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0312  hypothetical protein  32.09 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2479  hypothetical protein  34.39 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00521562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2549  hypothetical protein  36.3 
 
 
167 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7532  hypothetical protein  31.29 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.661485  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0207  hypothetical protein  26.19 
 
 
176 aa  44.7  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.143626  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0796  hypothetical protein  23.89 
 
 
120 aa  41.2  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>