24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2920 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2920  DoxX  100 
 
 
160 aa  318  1.9999999999999998e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0222503  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10640  DoxX protein  28.66 
 
 
186 aa  61.6  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0732523 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0502  hypothetical protein  30.32 
 
 
191 aa  59.3  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2102  DoxX family protein  28.39 
 
 
197 aa  58.9  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132413  normal  0.296398 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4739  DoxX family protein  28.77 
 
 
191 aa  58.9  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1241  DoxX family protein  31.93 
 
 
206 aa  56.6  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2516  DoxX family protein  24.54 
 
 
185 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0257788  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2245  DoxX family protein  29.49 
 
 
188 aa  54.3  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0747562  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0149  putative integral membrane protein  25 
 
 
190 aa  51.6  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.359577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1903  DoxX family protein  26.97 
 
 
184 aa  52  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.244663  normal  0.193783 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6943  DoxX family protein  26.92 
 
 
201 aa  51.2  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0083  DoxX family protein  28.4 
 
 
184 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1027  DoxX family protein  25.16 
 
 
174 aa  47.8  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.662698 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3491  DoxX family protein  26.32 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0699  TQO small subunit DoxD  31.03 
 
 
187 aa  44.7  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0366  hypothetical protein  30.28 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.678481  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0189  DoxX family protein  26.28 
 
 
177 aa  44.3  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284056  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2462  DoxX family protein  26.62 
 
 
174 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.984431  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0371  DoxX family protein  26.62 
 
 
174 aa  42.4  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167599  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0953  DoxX family protein  29.37 
 
 
185 aa  42.4  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.661535  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3582  DoxX family protein  24.07 
 
 
205 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3436  DoxX family protein  23.38 
 
 
182 aa  40.8  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2557  DoxX family protein  28.71 
 
 
253 aa  40.4  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3522  hypothetical protein  28.03 
 
 
182 aa  40.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>