19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0502 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0502  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  373  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0149  putative integral membrane protein  60 
 
 
190 aa  216  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.359577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1903  DoxX family protein  64.53 
 
 
184 aa  216  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.244663  normal  0.193783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2102  DoxX family protein  66.67 
 
 
197 aa  208  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132413  normal  0.296398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6943  DoxX family protein  67.11 
 
 
201 aa  205  4e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3436  DoxX family protein  58.19 
 
 
182 aa  200  9.999999999999999e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2245  DoxX family protein  62.89 
 
 
188 aa  197  6e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0747562  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3657  DoxX family protein  55.74 
 
 
184 aa  196  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010158  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3522  hypothetical protein  58.12 
 
 
182 aa  187  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0189  DoxX family protein  55.21 
 
 
177 aa  168  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3810  DoxX family protein  50.56 
 
 
182 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10640  DoxX protein  52.15 
 
 
186 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0732523 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4739  DoxX family protein  47.62 
 
 
191 aa  148  5e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2516  DoxX family protein  46.2 
 
 
185 aa  140  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0257788  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3582  DoxX family protein  48.26 
 
 
205 aa  133  9.999999999999999e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8099  putative integral membrane protein  35.48 
 
 
119 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1241  DoxX family protein  35.23 
 
 
206 aa  49.7  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0953  DoxX family protein  33.33 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.661535  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2920  DoxX  30.32 
 
 
160 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0222503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>