19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0953 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0953  DoxX family protein  100 
 
 
185 aa  358  3e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.661535  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0083  DoxX family protein  48.39 
 
 
184 aa  154  7e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3491  DoxX family protein  40.72 
 
 
177 aa  101  6e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1241  DoxX family protein  31.09 
 
 
206 aa  84.7  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1027  DoxX family protein  36.17 
 
 
174 aa  83.6  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.339861  normal  0.662698 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0371  DoxX family protein  34.54 
 
 
174 aa  73.6  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.167599  normal  0.293438 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2462  DoxX family protein  34.54 
 
 
174 aa  73.2  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.984431  normal  0.565782 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2056  DoxX family protein  33.33 
 
 
170 aa  54.7  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.991366  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2976  DoxX family protein  31.54 
 
 
171 aa  52.8  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6943  DoxX family protein  36.11 
 
 
201 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0502  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4739  DoxX family protein  26.74 
 
 
191 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4096  hypothetical protein  28.19 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000575667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14860  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  29.86 
 
 
593 aa  42.4  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846924  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4578  hypothetical protein  25.5 
 
 
166 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.413157  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3072  DoxX family protein  26.17 
 
 
166 aa  42  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4430  hypothetical protein  25.5 
 
 
166 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4085  hypothetical protein  25.5 
 
 
166 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.62393e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4247  hypothetical protein  25.5 
 
 
166 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000990049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>