19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2102 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2102  DoxX family protein  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0132413  normal  0.296398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2245  DoxX family protein  86.7 
 
 		 188 aa  315  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0747562  normal  0.0537084 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0502  hypothetical protein  66.67 
 
 		 191 aa  208  5e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0149  putative integral membrane protein  59.89 
 
 		 190 aa  207  9e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.359577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6943  DoxX family protein  56.19 
 
 		 201 aa  197  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1903  DoxX family protein  57.61 
 
 		 184 aa  197  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.244663  normal  0.193783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3657  DoxX family protein  53.55 
 
 		 184 aa  188  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3436  DoxX family protein  51.91 
 
 		 182 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2516  DoxX family protein  47.18 
 
 		 185 aa  176  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0257788  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0189  DoxX family protein  48.91 
 
 		 177 aa  168  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.284056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3810  DoxX family protein  46.81 
 
 		 182 aa  167  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235766 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10640  DoxX protein  57.14 
 
 		 186 aa  167  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0732523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3522  hypothetical protein  56.28 
 
 		 182 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4739  DoxX family protein  50.93 
 
 		 191 aa  144  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3582  DoxX family protein  41.55 
 
 		 205 aa  137  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8099  putative integral membrane protein  35.48 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1241  DoxX family protein  26.27 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2920  DoxX  27.74 
 
 		 160 aa  42.7  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0222503  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3491  DoxX family protein  26.11 
 
 		 177 aa  41.6  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>