26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0366 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP0366  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  317  3e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.678481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0731  DoxX family protein  75.8 
 
 
157 aa  246  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0747  DoxX family protein  75.8 
 
 
157 aa  246  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2566  DoxX family protein  28.17 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2557  DoxX family protein  28.68 
 
 
253 aa  62.8  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2976  DoxX family protein  25.81 
 
 
171 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2056  DoxX family protein  25 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.991366  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0699  TQO small subunit DoxD  29.91 
 
 
187 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3069  DoxX  31.76 
 
 
196 aa  50.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.755754  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2013  DoxX family protein  24.16 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0083  DoxX family protein  29.25 
 
 
184 aa  47.8  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3072  DoxX family protein  25.17 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.225032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0024  hypothetical protein  39.24 
 
 
170 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000226699  hitchhiker  0.00000131206 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4578  hypothetical protein  27.64 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.413157  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4085  hypothetical protein  27.64 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.62393e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4430  hypothetical protein  27.64 
 
 
166 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4247  hypothetical protein  27.64 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000990049  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14860  NADH dehydrogenase, FAD-containing subunit  26.92 
 
 
593 aa  45.1  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000846924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4096  hypothetical protein  27.64 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000575667  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4469  hypothetical protein  26.83 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000117454  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4482  hypothetical protein  26.83 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4197  DoxX family protein  25 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4431  hypothetical protein  26.83 
 
 
166 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0296378  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0768  hypothetical protein  27.93 
 
 
166 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000123691  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3491  DoxX family protein  33.94 
 
 
177 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1362  DoxX family protein  29.58 
 
 
191 aa  40.8  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>