33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2210 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2210  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  391  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1572  hypothetical protein  74.57 
 
 
198 aa  267  8e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.859986  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1596  hypothetical protein  72.25 
 
 
198 aa  263  8.999999999999999e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00989561  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1540  hypothetical protein  72.25 
 
 
198 aa  263  8.999999999999999e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3082  hypothetical protein  65.73 
 
 
195 aa  244  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.211768 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3339  hypothetical protein  65.17 
 
 
195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.162777 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2609  hypothetical protein  61.2 
 
 
199 aa  242  3e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.646996  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3530  hypothetical protein  63.84 
 
 
195 aa  239  1e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1021  hypothetical protein  53.81 
 
 
197 aa  231  6e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0952714  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3485  hypothetical protein  57.65 
 
 
182 aa  207  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.257261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1717  hypothetical protein  53.65 
 
 
205 aa  207  1e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1791  hypothetical protein  53.65 
 
 
249 aa  205  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.7405 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3380  hypothetical protein  56.73 
 
 
210 aa  205  4e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2127  hypothetical protein  53.65 
 
 
205 aa  204  7e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0516  hypothetical protein  56.21 
 
 
214 aa  203  1e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4040  hypothetical protein  62.34 
 
 
214 aa  201  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.10225  normal  0.0382421 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1687  hypothetical protein  51.58 
 
 
200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.101223  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4251  hypothetical protein  52.88 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.173324  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1813  hypothetical protein  56.47 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768116  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3924  hypothetical protein  55.95 
 
 
197 aa  198  5e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.0000157363  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3682  hypothetical protein  55.88 
 
 
198 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0758613  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4843  hypothetical protein  55.62 
 
 
201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216907  normal  0.0416972 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6564  hypothetical protein  56.88 
 
 
204 aa  194  6e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1021  hypothetical protein  50.26 
 
 
197 aa  186  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.414164  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1620  hypothetical protein  55.7 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00218632 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2168  hypothetical protein  46.93 
 
 
218 aa  168  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0615786  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1688  hypothetical protein  44.39 
 
 
191 aa  167  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0108944  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0140  hypothetical protein  49.41 
 
 
200 aa  165  5e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0988  hypothetical protein  44.38 
 
 
210 aa  160  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4773  hypothetical protein  44.72 
 
 
260 aa  148  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0149963  normal  0.0439036 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1340  hypothetical protein  45.57 
 
 
259 aa  148  6e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.299322  normal  0.183738 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1182  hypothetical protein  41.49 
 
 
201 aa  145  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0791  hypothetical protein  41.46 
 
 
267 aa  145  5e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.219826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>