23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0210 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0210  putative prophage repressor  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6981  transcriptional regulator, XRE family  31.46 
 
 		 245 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3612  putative prophage repressor  32 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5087  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2499  transcriptional regulator, XRE family  31.71 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.500321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  30.56 
 
 		 227 aa  67.8  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1543  helix-turn-helix domain-containing protein  25.81 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.515092  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2457  peptidase S24 and S26 domain protein  28.77 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.16155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1503  LexA repressor  25.37 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.106376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5730  XRE family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0478  LexA family transcriptional repressor  33.33 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.114058  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14611  SOS function regulatory protein, LexA repressor  33.82 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.748093  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0551  transcriptional regulator, XRE family  24.62 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.401249  hitchhiker  0.0000933135 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14231  SOS function regulatory protein, LexA repressor  35.29 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.438746  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2366  peptidase  27.92 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000799679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  29.29 
 
 		 281 aa  48.1  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000786405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5333  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.86 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2632  hypothetical protein  33.72 
 
 		 126 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14471  SOS function regulatory protein, LexA repressor  30.22 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.972775  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0274  transcriptional repressor LexA, putative  28.08 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0884  transcriptional repressor LexA, putative  28.08 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0403534  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0251  transcriptional repressor LexA, putative  28.08 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00843575  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13051  SOS function regulatory protein, LexA repressor  34.03 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.220782 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>