24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0009 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0009  tRNA-Gln  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0003  tRNA-Gln  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0018  tRNA-Gln  92.86 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.751418  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  86.57 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268134  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2742  tRNA-Gln  86.57 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.000362566  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0045  tRNA-Gln  86.57 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000000515378  hitchhiker  0.000000000930227 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0053  tRNA-Gln  88.89 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0049  tRNA-Gln  96.55 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.866993  normal  0.692724 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0004  tRNA-Gln  85.25 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0919548 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0032  tRNA-Gln  86.79 
 
 
74 bp  50.1  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0043  tRNA-Gln  90 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0004  tRNA-Gln  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0001  tRNA-Gln  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0041  tRNA-Gln  93.55 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0004  tRNA-Gln  96.3 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0038  tRNA-Gln  83.87 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.132474  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0026  tRNA-Gln  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.327686  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0008  tRNA-Gln  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629298  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0020  tRNA-Gln  83.87 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4559  tRNA-Gln  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0008  tRNA-Gln  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112331  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  96.15 
 
 
75 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>