19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2153 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2153  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  390  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0101  hypothetical protein  47.12 
 
 
206 aa  172  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0267  hypothetical protein  42.86 
 
 
221 aa  144  9e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.583033 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3171  hypothetical protein  39.68 
 
 
207 aa  137  8.999999999999999e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1789  hypothetical protein  24.17 
 
 
254 aa  57.4  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1665  hypothetical protein  24.73 
 
 
208 aa  48.1  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1563  putative circadian clock protein, KaiC  31.48 
 
 
237 aa  46.2  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.219998  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1116  circadian clock protein KaiC  30 
 
 
550 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  30 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1297  putative circadian clock protein, KaiC  43.48 
 
 
492 aa  42.7  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2095  KaiC  37.18 
 
 
243 aa  42.7  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3464  hypothetical protein  25 
 
 
207 aa  42.7  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  39.22 
 
 
301 aa  42.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 
503 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  43.48 
 
 
507 aa  41.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0519  hypothetical protein  24.26 
 
 
209 aa  41.6  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  41.2  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  33.33 
 
 
242 aa  41.2  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2299  hypothetical protein  25.63 
 
 
209 aa  41.2  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.281266  normal  0.528912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>