16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0545 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0545  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 128 aa  257  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0133  DNA polymerase, beta-like region  44.35 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1404  DNA polymerase, beta-like region  44.17 
 
 		 132 aa  96.7  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.304011  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0766  DNA polymerase, beta-like region  32.32 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.576445  normal  0.367206 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4276  DNA polymerase beta domain protein region  37.97 
 
 		 261 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2954  DNA polymerase beta subunit  28.18 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2563  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2558  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1046  DNA polymerase, beta-like region  32.1 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.646258  normal  0.089906 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  32.67 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2352  DNA polymerase, beta-like region  28.7 
 
 		 148 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00951181  normal  0.0970434 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0269  nucleotidyltransferase  32.05 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2550  DNA polymerase beta domain protein region  41.79 
 
 		 230 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0464694 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0545  DNA polymerase beta domain protein region  27.78 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00116753  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2848  hypothetical protein  44.9 
 
 		 108 aa  40  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2195  DNA polymerase beta domain protein region  28.46 
 
 		 145 aa  40  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000295232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>