32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2165 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2165  protein of unknown function DUF201  100 
 
 		 412 aa  805    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111476  normal  0.292956 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1830  hypothetical protein  94.12 
 
 		 374 aa  652    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1781  protein of unknown function DUF201  85.98 
 
 		 378 aa  601  1e-170  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6003  protein of unknown function DUF201  61.5 
 
 		 376 aa  362  9e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.866607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0529  hypothetical protein  60.58 
 
 		 383 aa  356  5e-97  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.865986 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5779  hypothetical protein  54.64 
 
 		 384 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0168364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3534  hypothetical protein  40.53 
 
 		 391 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.72291 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2386  protein of unknown function DUF201  41.6 
 
 		 381 aa  202  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0260  hypothetical protein  32.05 
 
 		 403 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3083  protein of unknown function DUF201  37.4 
 
 		 380 aa  162  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1659  hypothetical protein  34.28 
 
 		 354 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.256819  normal  0.444616 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5947  hypothetical protein  35.26 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2608  hypothetical protein  36.9 
 
 		 386 aa  153  7e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0133551  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2862  hypothetical protein  33.9 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2432  hypothetical protein  33.5 
 
 		 402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.171151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6483  hypothetical protein  31.91 
 
 		 407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.422069 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3151  hypothetical protein  31.96 
 
 		 415 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1666  hypothetical protein  25.13 
 
 		 355 aa  73.2  0.000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2798  hypothetical protein  26.58 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.105487 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1523  hypothetical protein  27.27 
 
 		 357 aa  57.4  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1641  hypothetical protein  27.62 
 
 		 299 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1043  hypothetical protein  23.46 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1278  hypothetical protein  22.61 
 
 		 357 aa  52.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.422818  normal  0.140099 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0371  hypothetical protein  20.68 
 
 		 290 aa  50.8  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000731332  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2010  protein of unknown function DUF201  23.68 
 
 		 360 aa  50.4  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  0.206685 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0329  hypothetical protein  22.7 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1440  hypothetical protein  21.62 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.357308  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1917  carbamoyl phosphate synthase large subunit  25.99 
 
 		 1065 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0448  hypothetical protein  20.95 
 
 		 311 aa  47  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00145655  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1583  hypothetical protein  21.6 
 
 		 302 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2022  protein of unknown function DUF201  23.75 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4917  D-alanine/D-alanine ligase  29.66 
 
 		 309 aa  43.1  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.912808  normal  0.0828736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>