46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1694 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_1694  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  580  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0479434  normal  0.501295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1420  hypothetical protein  96.63 
 
 		 297 aa  559  1e-158  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  0.13486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1416  hypothetical protein  85.19 
 
 		 297 aa  501  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.953514  normal  0.0498255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4978  Beta tubulin, autoregulation binding site  63.97 
 
 		 291 aa  362  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000412086 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3460  bacteriophage protein  51.79 
 
 		 306 aa  286  4e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1179  hypothetical protein  49.49 
 
 		 297 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.335726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2115  hypothetical protein  50.35 
 
 		 303 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0742947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1424  phage protein  49.83 
 
 		 298 aa  279  5e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.784569  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4294  hypothetical protein  47.8 
 
 		 294 aa  277  2e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.4192  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3169  phage protein  49.83 
 
 		 296 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199001  normal  0.0261445 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1822  bacteriophage protein  50.71 
 
 		 296 aa  272  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0287407  normal  0.370598 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1991  bacteriophage protein  49.29 
 
 		 307 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0367109  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7314  hypothetical protein  46.44 
 
 		 294 aa  269  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2010  hypothetical protein  46.44 
 
 		 294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.963888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6572  hypothetical protein  46.44 
 
 		 294 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2601  hypothetical protein  46.1 
 
 		 294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5970  hypothetical protein  48.24 
 
 		 297 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.630927  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0272  phage protein  44.41 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0917  hypothetical protein  47.5 
 
 		 288 aa  248  6e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0599  hypothetical protein  48.38 
 
 		 291 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100982  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0795  hypothetical protein  44.41 
 
 		 295 aa  245  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3712  NlpC/P60 family phage cell wall peptidase  44.95 
 
 		 294 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1351  hypothetical protein  44.11 
 
 		 296 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2165  hypothetical protein  44.1 
 
 		 296 aa  232  4.0000000000000004e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2477  hypothetical protein  44.41 
 
 		 294 aa  220  3e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.883533  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1070  phage protein  44.06 
 
 		 292 aa  218  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.139012 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1087  hypothetical protein  42.56 
 
 		 294 aa  218  8.999999999999998e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0412528  normal  0.0298514 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1142  hypothetical protein  44.75 
 
 		 294 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.147655  normal  0.84612 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1644  phage protein  42.07 
 
 		 292 aa  211  1e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2889  phage protein  42.38 
 
 		 272 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0194233  normal  0.242623 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2487  hypothetical protein  32.56 
 
 		 292 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0748  hypothetical protein  29.37 
 
 		 268 aa  147  3e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.199335  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1991  phage protein  38.01 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000642219  normal  0.0137589 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3903  hypothetical protein  50.92 
 
 		 216 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.627061  normal  0.117585 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0254  hypothetical protein  25 
 
 		 269 aa  138  1e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.121128  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0835  hypothetical protein  24.82 
 
 		 271 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.794206  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0931  hypothetical protein  47.06 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.258225 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3130  phage protein  35.96 
 
 		 273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71387  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7156  hypothetical protein  33.33 
 
 		 362 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0776178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3056  hypothetical protein  27.05 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2726  hypothetical protein  29.48 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000479777  normal  0.0230175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4082  hypothetical protein  28.66 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.086292  normal  0.0251599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1645  hypothetical protein  29.08 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.295696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0286  hypothetical protein  28.36 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1314  putative phage associated protein  29.41 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1080  hypothetical protein  26.25 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>