37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0110 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0110  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  175  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3822  hypothetical protein  67.82 
 
 
88 aa  116  9e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4259  hypothetical protein  65.91 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3841  hypothetical protein  61.36 
 
 
88 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.191666  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0318  hypothetical protein  68.18 
 
 
88 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118234  normal  0.049984 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4377  hypothetical protein  57.95 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.605573  normal  0.156449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3805  hypothetical protein  53.01 
 
 
102 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0221  hypothetical protein  51.95 
 
 
102 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0535  hypothetical protein  40.26 
 
 
86 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.254153  normal  0.0144913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6387  hypothetical protein  45.45 
 
 
85 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.857181  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3922  hypothetical protein  43.04 
 
 
85 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2245  hypothetical protein  43.59 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3204  hypothetical protein  38.96 
 
 
88 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0845  hypothetical protein  42.31 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5644  hypothetical protein  40.48 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2038  hypothetical protein  43.59 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.702942  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2793  hypothetical protein  41.56 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5665  hypothetical protein  38.64 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0521  hypothetical protein  42.31 
 
 
87 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6414  hypothetical protein  40.74 
 
 
146 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184599  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1859  hypothetical protein  39.24 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.513735  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2419  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.765292 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2886  hypothetical protein  42.5 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8153  hypothetical protein  39.74 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7629  hypothetical protein  39.74 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0103  hypothetical protein  35.63 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3970  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0834  hypothetical protein  40.26 
 
 
94 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308596  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3973  hypothetical protein  42.31 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1583  hypothetical protein  37.66 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0472662 
 
 
-
 
NC_010373  M446_6973  hypothetical protein  34.94 
 
 
86 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1170  hypothetical protein  36.59 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.264773  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1874  hypothetical protein  40.51 
 
 
85 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2976  hypothetical protein  38.46 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6106  hypothetical protein  38.46 
 
 
82 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8737  hypothetical protein  35.9 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6413  hypothetical protein  37.18 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>