15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0477 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_0477  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  277  4e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.446082  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3334  hypothetical protein  51.47 
 
 
168 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.129263  normal  0.0637905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3411  hypothetical protein  34.68 
 
 
158 aa  68.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1553  hypothetical protein  28.24 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000880157 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1100  hypothetical protein  26.87 
 
 
145 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0789  hypothetical protein  30.7 
 
 
169 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0408  Protein of unknown function DUF2495  32.58 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.991858  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0328  hypothetical protein  28.69 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0426  hypothetical protein  27.27 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00311673  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0448  hypothetical protein  26.52 
 
 
145 aa  50.4  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0943  hypothetical protein  28.15 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.367982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2713  hypothetical protein  38.37 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000196179 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3115  hypothetical protein  38.37 
 
 
161 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2700  hypothetical protein  26.09 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1519  hypothetical protein  25.74 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>