17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1190 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1190  hypothetical protein  100 
 
 
192 aa  389  1e-107  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.550664  normal  0.0144222 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1070  TM2 domain-containing protein  35.62 
 
 
176 aa  124  8.000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.607501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2044  hypothetical protein  39.22 
 
 
151 aa  123  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.00000000000114034  normal  0.017313 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2493  TM2 domain-containing protein  38.68 
 
 
119 aa  93.6  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1652  TM2 domain-containing protein  36.75 
 
 
108 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.503869  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0456  hypothetical protein  26.9 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.116947 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2096  hypothetical protein  46.25 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3451  hypothetical protein  35.96 
 
 
106 aa  65.1  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.950641  normal  0.149126 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0355  TM2 domain containing protein?  37.97 
 
 
110 aa  58.5  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00269193 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22460  hypothetical protein  29.82 
 
 
188 aa  53.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1029  hypothetical protein  31.5 
 
 
249 aa  48.5  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13900  hypothetical protein  44.19 
 
 
181 aa  45.1  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3809  signal peptidase I  33.61 
 
 
373 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0108  hypothetical protein  47.62 
 
 
175 aa  43.5  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.132118  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3710  signal peptidase I  40.98 
 
 
272 aa  43.5  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.761462 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0473  hypothetical protein  36.62 
 
 
71 aa  42.7  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28616  VIC family transporter: potassium ion channel  36.67 
 
 
400 aa  41.2  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>