26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0068 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0068  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.544619  normal  0.0107968 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0067  tRNA-Glu  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.772676  normal  0.0107371 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0010  tRNA-Glu  96.15 
 
 		 78 bp  131  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0017  tRNA-Glu  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000000132738  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0046  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0019  tRNA-Glu  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0015  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0154523  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0043  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0030  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0016  tRNA-Glu  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_R0016  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.510294 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0017  tRNA-Glu  89.66 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0045  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.556682  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0019  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0016  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0042  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.81664 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0007  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0034  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.238883  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0046  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0017  tRNA-Glu  89.58 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_R0028  tRNA-Asp  90 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00270528  hitchhiker  0.000366483 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0042  tRNA-Glu  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.835093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_R0040  tRNA-Glu  85.71 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  CMAQ_0  tRNA-Glu  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00654824 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_R0002  tRNA-OTHER  87.23 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.087724 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0019  tRNA-Gln  87.76 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>