26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1004 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1004  signal sequence peptidase  100 
 
 
185 aa  379  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1734  peptidase S26B, signal peptidase  65.7 
 
 
184 aa  238  4e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0660  signal sequence peptidase  45.19 
 
 
219 aa  159  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.269803  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1611  signal sequence peptidase  44.32 
 
 
217 aa  147  8e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0002  Signal peptidase I-like protein  39.15 
 
 
365 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.756287 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0003  Signal peptidase I-like protein  39.36 
 
 
319 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1612  Signal peptidase I-like protein  41.71 
 
 
370 aa  131  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0046  peptidase S26B, signal peptidase  42.78 
 
 
222 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1932  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  38.95 
 
 
353 aa  125  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2411  peptidase S26B, signal peptidase  43.02 
 
 
235 aa  123  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0816  signal sequence peptidase  36.51 
 
 
215 aa  119  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.019446  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0124  metal dependent phosphohydrolase  38.2 
 
 
218 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1944  signal peptidase I (signal sequence peptidase)  36.63 
 
 
288 aa  100  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.486275  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0410  peptidase S26B, signal peptidase  35.05 
 
 
236 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0037  hypothetical protein  42.54 
 
 
321 aa  97.1  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1241  hypothetical protein  36.54 
 
 
228 aa  84.3  8e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0002  signal peptidase I  27.27 
 
 
275 aa  58.9  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2579  signal peptidase I  30.15 
 
 
166 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.767208  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10354  Signal peptidase I (AFU_orthologue; AFUA_3G12840)  25.42 
 
 
192 aa  48.9  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0778272  normal  0.862016 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2281  signal peptidase I  29.41 
 
 
166 aa  47.8  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0985  peptidase S26B, signal peptidase  29.75 
 
 
368 aa  46.6  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.782251  normal  0.031118 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36729  Signal sequence processing protein  27.86 
 
 
166 aa  44.7  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.501968  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2196  peptidase S26B, signal peptidase  28.24 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0208  peptidase S26B, signal peptidase  24.1 
 
 
236 aa  42.7  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1032  peptidase S26B, signal peptidase  27.71 
 
 
179 aa  42  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0909438 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2015  peptidase S26B, signal peptidase  29.71 
 
 
197 aa  41.2  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000493548  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>