31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0047 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0047  transposase  100 
 
 
228 aa  459  9.999999999999999e-129  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000000399191  normal  0.0497457 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1988  transposase  93.49 
 
 
216 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.676841  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0718  transposase, IS4 family protein  28.29 
 
 
415 aa  63.5  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0553723  normal  0.0430259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0717  hypothetical protein  26.22 
 
 
369 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137739  normal  0.0455939 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0001  transposase IS4  27.71 
 
 
379 aa  62.4  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.127623  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3793  transposase IS4 family protein  29.35 
 
 
628 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209171  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2828  transposase IS4 family protein  24.56 
 
 
692 aa  52.4  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1353  transposase IS4 family protein  26.8 
 
 
370 aa  52  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0265  transposase IS4 family protein  26.21 
 
 
350 aa  49.3  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3567  transposase IS4 family protein  22.81 
 
 
687 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2371  hypothetical protein  27.33 
 
 
349 aa  46.6  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.263033 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2118  transposase IS4 family protein  25.52 
 
 
350 aa  46.6  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2208  transposase IS4 family protein  25.52 
 
 
350 aa  46.6  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1497  transposase IS4 family protein  25.52 
 
 
363 aa  46.2  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2942  transposase IS4 family protein  21.5 
 
 
558 aa  46.2  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2591  transposase IS4 family protein  25.52 
 
 
375 aa  46.2  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2043  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 
363 aa  45.4  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.547441  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1474  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 
363 aa  45.4  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2513  transposase IS4 family protein  24.83 
 
 
350 aa  45.4  0.0008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4318  ISPpu8, transposase  29.63 
 
 
433 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2522  ISPpu8, transposase  29.63 
 
 
433 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683526  normal  0.983259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2218  ISPpu8, transposase  29.63 
 
 
433 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2114  ISPpu8, transposase  29.63 
 
 
433 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1990  ISPpu8, transposase  29.63 
 
 
433 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.396033  normal  0.106664 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1865  ISPpu8, transposase  29.63 
 
 
433 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.295168  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2857  transposase IS4 family protein  21.26 
 
 
390 aa  42  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0054  transposase IS4 family protein  21.26 
 
 
390 aa  42  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00175854 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1024  transposase IS4 family protein  21.26 
 
 
390 aa  42  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.765298  normal  0.715821 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1606  transposase IS4 family protein  21.26 
 
 
390 aa  42  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.207123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1840  transposase IS4 family protein  21.26 
 
 
390 aa  42  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.156024  normal  0.289357 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3439  transposase IS4 family protein  21.26 
 
 
390 aa  42  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>