40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0066 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0066  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0146  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0075  hypothetical protein  45.9 
 
 
67 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.356235  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0126  hypothetical protein  49.18 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.831576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0123  hypothetical protein  47.54 
 
 
67 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0121  hypothetical protein  45.9 
 
 
67 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.932988  normal  0.0212568 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0184  hypothetical protein  56.45 
 
 
69 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00980  hypothetical protein  53.85 
 
 
68 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04024  hypothetical protein  42.86 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0550  hypothetical protein  43.64 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.279  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0282  hypothetical protein  44.44 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4166  hypothetical protein  43.64 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.966786 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01330  hypothetical protein  56.45 
 
 
69 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861282  normal  0.982604 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0188  putative transmembrane protein  39.66 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6171  hypothetical protein  51.06 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0495  hypothetical protein  41.82 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0431  hypothetical protein  41.82 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3192  hypothetical protein  41.82 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2852  hypothetical protein  48.94 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.13457  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2855  hypothetical protein  41.82 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.777387  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0513  hypothetical protein  41.82 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1428  hypothetical protein  41.82 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0164  hypothetical protein  41.82 
 
 
83 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2841  hypothetical protein  48.94 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.353606  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0678  hypothetical protein  46.81 
 
 
161 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321937  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0319  transmembrane protein  36.23 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2758  hypothetical protein  43.64 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996183  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0462  hypothetical protein  41.82 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0808424  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0266  hypothetical protein  39.66 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.964939 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0368  hypothetical protein  49.02 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0475  hypothetical protein  36.84 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0451  hypothetical protein  36.84 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0331  hypothetical protein  40.91 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.544254  decreased coverage  0.009055 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0224  putative transmembrane protein  38.89 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.508917 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0315  hypothetical protein  33.93 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.172325 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1384  putative transmembrane protein  44.07 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.074752  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6263  hypothetical protein  42.42 
 
 
70 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.461612 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1250  putative transmembrane protein  44.07 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.342976  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0243  hypothetical protein  37.04 
 
 
69 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0138719 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6549  hypothetical protein  42.42 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>