30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0138 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  959    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  34.74 
 
 		 497 aa  244  3e-63  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  23.37 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  23.44 
 
 		 438 aa  75.5  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  22.08 
 
 		 419 aa  73.6  0.000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  22.66 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  23.86 
 
 		 421 aa  70.1  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  23.86 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  23.86 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.810342 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  23.86 
 
 		 421 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  23.6 
 
 		 428 aa  68.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  23.65 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  20.73 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  23.86 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  21.12 
 
 		 423 aa  54.3  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  23.17 
 
 		 425 aa  53.5  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  22.17 
 
 		 425 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  22.57 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  22.75 
 
 		 425 aa  52  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  22.44 
 
 		 425 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  22.44 
 
 		 425 aa  50.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  22.99 
 
 		 425 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  22.99 
 
 		 425 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  22.51 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  25.1 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  20.05 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  22.39 
 
 		 427 aa  43.5  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>